В 1987 году скауты из "Монако" присутствовали на игре юниоров "ФК Дьепп" против "Пари Ль'обстинатьон". В этом матче команда Эмманюэля одержала крупную победу со счётом 5:2. Проигрывая после первого тайма 0:2, на поле появился Пети, который и стал главным героем этой встречи. Выйдя на замену, он забил гол, отдал два голевых паса и заработал пенальти. Пару недель спустя к французу прислали официальных представителей из "Монако", но уехал он к монегаскам лишь в сентябре 1988 года.
В "Монако" Эмманюэль сначала тренировался с молодёжной командой, а 18 марта 1989 он впервые вышел на поле в стартовом составе на матч против "Сошо", который закончился со счётом 0:0. Тренируясь под руководством Арсена Ванже, Пети постоянно прогрессировал в своей игре. Именно Ванже начал по необходимости использовать его в обороне. Свой первый гол он забил 28 июля 1990 года в игре с "Осером" на выезде, тот матч закончился со счётом 0:1. Через три недели он провёл свой дебютный матч за сборную Франции. Это была нулевая ничья с поляками 15 августа 1990 года. Всего Пети провёл за сборную около 47 игр, и забил четыре гола. Многие помнят два из них, забитые на ЧМ-98.
За "Монако" Эмманюэль отыграл девять сезонов, провёл 222 официальных встречи и забил 4 гола. В составе "Монако" он стал обладателем Кубка Франции (1991) и в 1997 году стал чемпионом cтраны, а 4 июня 1997-го он вместе с Жилем Гриманди уехал в "Арсенал".
Свой первый сезон в Англии ему будет нелегко забыть. Ведь именно в сезоне 1997/98 он стал чемпионом Англии и обладателем Кубка Англии в составе "Арсенала" и чемпионом мира в составе сборной Франции. В том сезоне Пети забил два гола, один из которых в 35-м туре в матче против "Дерби Каунти" был единственным и принёсшим "Арсеналу" важные три очка. Кстати, в том же году он выиграл в казино Лас-Вегаса 20 тысяч фунтов стерлингов. Летом 2000 года стал чемпионом Европы, хотя финальный матч пропустил из-за травмы. После окончания чемпионата Пети женился.
Отыграв один сезон в испанской "Барселоне", Маню в 2001 году перешёл в лондонский "Челси".